清水河乡在天山中段山体较西部宽厚，冰川积雪较丰厚，气候较湿润，是新疆药材较丰富地区。享有盛名的新疆一枝蒿、雪莲花、秦艽分佈於此，还有伊贝母、狭叶红景天、阿魏、赤芍、麻黄、豹骨等。东部有较大面积的森林，主要药材有雪莲花、秦艽、龙胆、黄芪、紫菀、新疆党参、瞿麦、乌头、麻黄、沙棘、马鹿茸等。